从工资扣工会费不合法。用人单位可以代扣劳动者工资的情形：用人单位代扣代缴的个人所得税；法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；其他。

《工资支付暂行规定》第十五条
用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；
（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。